上集中异形并没有被消灭掉，她又回来了，变得更加的强大，这次的主角轮到别克的女儿朱丽娅了，她和另一个伙伴要继续面对新的挑战了
赤松德郎是个脚踏实地的小型运输公司老板，一直努力维持公司，然而某天他公司的货车发生轮胎飞脱导致年轻母亲死亡的事件，在警方和媒体都认为他是杀人凶手之时，赤松查出全国都出现类似的事故，全部都涉及大型汽车制造商「希望汽车公司」的汽车，于是赤松为了证明自己无罪讨回公道，只身挑战庞大企业。
最近，美丽少女伊瑞娜（娜塔莎·金斯基 Nastassja Kinski 饰）发现了隐藏在自己家族中的秘密，这一发现源于她和哥哥保罗（马尔科姆·麦克道威尔 Malcolm McDowell 饰）之间的不伦之恋，当他们肌肤相亲时，伊瑞娜居然变身成为了一只残暴嗜血的豹子。随着这个秘密的揭开，伊瑞娜被关进了动物园，动物学家奥利弗（约翰·赫德 John Heard 饰）成为了她的负责人。 随着时间的推移，奥利弗渐渐发现了伊瑞娜的不平凡之处，并被其深深的吸引了，这让奥利弗的同事爱丽丝（安妮特·奥图 Annette O'Toole 饰）十分不满。同样感到不满的还有保罗，他告诉伊瑞娜，如果想要恢复人形，唯一的方法就是杀掉奥利弗。面临艰难的选择，伊瑞娜不知该何去何从。
丹尼（方·基默 Val Kilmer 饰）从前拥有一个幸福的家庭，和妻子之间十分的恩爱。然而，不幸降临在了这个家庭之中，丹尼的妻子死在了毒贩的手中，而丹尼则成为了这一场惨剧的目击者。愤怒而又绝望的丹尼发誓要替妻子报仇，他前往洛杉矶大名鼎鼎的沙顿海，那里是毒贩和黑手党的聚集地，他要杀的人就在那里。 丹尼隐姓埋名成为了警方的线人被安插在贩毒团伙之中，在寻仇的过程中，丹尼渐渐的迷失了自我，对他自己所做的一切事情的意义产生了怀疑，唯一支撑着他继续走下去的，便是妻子温柔的面庞。不仅如此，丹尼还有这一个音乐梦，他随身携带着一支小号，奏响自己的命运。
杀人越货的罪犯连续神秘死亡，人们将替天行道惩治恶人的基拉奉为救世主，警方对之束手无策。专门解决奇诡事件的天才少年L推断，基拉有97%的可能性身在日本，于是他离开洛杉矶飞赴日本。临行之前，L心中浮起淡淡的预感——自己可能再也回不来了。
L与基拉——夜神月的展开了正面交锋。这时，泰国的一个小村庄被人从大地上抹去了痕迹。L并不知道有一桩足以毁灭世界的重大阴谋正在酝酿之中。
L以自己的生命为代价设下陷阱准备一举击溃夜神月，不料，多年的搭档渡意外身亡。L决定在自己最后的23天中解决渡所留下的任务。直升机送来了一箱给渡的礼物，里面竟是一个男孩——他是遭灭顶之灾的泰国小村的唯一幸存者。L从男孩随身携带的磁碟资料中得知，该事件与恐怖的杀人病毒有关。此时，少女真希带着父亲的遗物来找渡，她也是这场阴谋的受害者。追踪而来的杀手已然赶到，L带着两个孩子开始了逃亡。只剩6天了，L决定与阴谋者决一死战。
