阳光明媚的青青大草原，喜羊羊（祖晴 配音）期待已久的日子到来了。他的爸爸妈妈预计这一天返回羊村，于是他找来小伙伴们帮忙打扫房间。就在此时，一艘小型飞艇带着火光坠落大草原，众人匆匆忙忙跑了过去，却发现飞艇里跳出一个可爱的小羊。小羊名叫冰冰羊，她父母的飞船遭到破坏，危急关头她被爸爸妈妈送到地球寻找哥哥。与此同时，正在捕猎的灰太狼受到另一个外星来客的袭击并遭到附体。原来智羊羊和丽羊羊冷藏了一个叫“细菌大王”的外星大坏蛋，却不小心被冰冰羊释放了出来。 他们的出现，将给青青草原带来新的危机和冒险……
在古老的香都王国，意大利旅行家马可-波罗告别可汗，准备返回自己的家乡。为维护友谊，可汗欲将充满神奇力量的魔法金币送给他。不料，对王位垂涎已久的大臣福林却寻机偷走金币，随后便隐匿无踪。可汗得知真相后，将自己随身携带的金币一分为二，送给老马可。凭借这半枚金币，他们的后人可以穿梭时空。一旦两家人相聚，金币便可重获魔力。 时光飞逝，老马可的后裔小马可已经长成英俊青年。他佩戴祖传的半枚金币，历尽艰难险阻，来到香都王国。在海鸥瑞杰等朋友的帮助下，小马可终于揭开金币之谜，并从福林手中夺回了被窃走的金币，救出了可爱的荷花公主。但福林却再次出现，派出秃鹫赖古再次抢走了荷花公主手中的金币。为了伸张正义，惩处恶魔，小马可又踏上了征程……
在本季《超级飞侠》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。 而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
擅长机甲骗术的秦明，被擅长解谜的白齐拉去当金吾卫，成为辟火司的救火员，在雷火案中结识了兵马司的“一姐”荆一飞，三人组成探案小队，不仅要拨开层层迷雾，更了解了各自的身世，以及身为金吾卫的职责和意义。
